Ученые нашли дешевый и быстрый способ построения генома с нуля
Секвенирование и построение генома с нуля, мягко говоря, весьма недешевая процедура. Это иногда бывает доступно в случаях с человеческими геномами, но часто оказывается слишком дорого (сотни тысяч долларов), когда речь идет об освоении «новой территории» – скажем, конкретного человека или неизвестного существа. Ведь хромосома может иметь сотни миллионов генетических пар оснований.
Однако, возможно, недавно ученым удалось найти способ сделать построение генома гораздо более доступным. Они разработали новый метод расшифровки генома — трехмерную сборку, с помощью которой можно осуществить секвенирование и построение генома менее чем за 10 тысяч долларов.
Если ранее исследователи использовали компьютеры, чтобы «склеить» небольшие кусочки генетического кода, новая методика использует преимущество «складных карт» для быстрого построения последовательности. Поскольку в этом случае необходимы только короткие фрагменты (риды) ДНК, стоимость существенно снижается. Кроме того, нет необходимости в большом количестве информации о происхождении образца.
С целью демонстрации возможностей своего метода, исследователи впервые полностью собрали три хромосомы для комара Aedes aegypti . Более сложные организмы, разумеется, потребуют больше работы, но существенное снижение цены делает это как никогда более реальным. При условии, что новый подход получит широкое распространение, он может оказаться невероятно ценным как для биологии, так и для медицины.
В случае с комаром ученые надеются, что расшифровка генома позволит выявить его слабые места, которые делают возможным распространение вируса Зика. Возможно, появятся генно-модифицированные комары, которые будут устойчивы к вирусу и остановят его распространение.
С другой стороны, могут быть раскрыты генетические изменения, свойственные для конкретного пациента, которые определяют его восприимчивость к определенным заболеваниям. Тогда можно будет понять, почему один человек заболевает, в то время как другой остается здоровым. А когда это станет настолько доступным, что можно будет строить геномы просто из любопытства, биологи смогут каталогизировать многие виды организмов, а не только наиболее важные образцы.
30.03.2017 7:07
