Карта белков-мутантов несомненно поможет искать уязвимости раковых клеток — Ученые
Русские ученые из МФТИ и иных институтов представили метод для обнаружения в клетках мутантных белков. Статья с результатами работы отечественных профессионалам была размещена в издании Proteomics.
Точечные замены аминокислотных остатков в белках в результате мутации ДНК могут приводить к изменению функций белков в клетках.
Как принято считать, некоторые из похожих функциональных изменений становятся главными для последующего развития злокачественных опухолей.
Группа Михаила Горшкова рассчитывает, что обнаруженный метод поиска уязвимостей в раковых клетках с применением карты белков-мутантов ускорит разработку лекарства от онкологического заболевания. Технологии «больших данных» в биологии позволили, с одной стороны, проводить не менее масштабные эксперименты и извлекать больше полезного из биологического материала. Такая культура часто применяется в научных исследованиях в качестве модели клеток человека, так как ее довольно просто растить в лабораториях. Красным цветом отмечена позиция мутации (замена аминокислотного остатка S на P) и пики в масс-спектре фрагментации, подтверждающие присутствие данной замены.
Данные, приобретенные учеными в процессе исследования, основываются на протеогеномных технологиях. Для протеогеномного анализа ученые подготовили расширенную базу данных на основе результатов секвенирования экзома клеточной линии HEK-293. Секвенирование экзома дает возможность сосредоточить внимание исследователей только на белок-кодирующих генах, а кроме этого определить расположение экзонов в них. Так в белковый «словарь» добавились расстановки, которые отличаются от начальных на одну либо несколько «букв» — аминокислот. Без такой подробной базы поисковая программа не могла бы результативно находить частично «неправильные» белки. Применяя масс-спектроскопический анализ, ученые смогут установить эти отклонения, тем самым обнаружив измененные клетки. По достоверной информации исследования, общее число «мутантов» в рассматриваемых клетках возросло больше, чем на сотню белковых молекул.
По последней располагаемой информации анализа ученые определили, какие белки либо их фрагменты содержатся в клетках HEK-293, и отыскали мутации белков, для некоторых из которых до этого была показана связь с разными типами рака. Чтобы продемонстрировать методику, ученые под предводительством Горшкова учили совокупность мутировавших белков в одной из видов раковых клеток. Вполне возможно, наличие этих вариантов способствует лучшему выживанию и размножению клеток. По утверждению Михаила Горшкова, ученого из МФТИ, методика может в дальнейшем быть полезной для поиска раковых мутаций. В частности, один из найденных геномных способов относится к белку p53, подавляющему злокачественное преобразование клетки.
Русским ученым удалось создать новый метод поиска белков-мутантов.
26.08.2016 13:10
